167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0486 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  56.91 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  57.03 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  53.44 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  54.47 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  56.59 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  57.8 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  53.12 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  56 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  53.66 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  52.42 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  55.28 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  54.69 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  49.21 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  54.96 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  54.62 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  52.85 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  49.58 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  48.46 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  53.03 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  52.46 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  46.03 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  50.77 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  45.08 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  54.24 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  51.64 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  52.14 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  49.28 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  49.28 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  49.28 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  52.03 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  53.39 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  44.2 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  48.2 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  48.2 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  48.36 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  48.41 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  47.14 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  50.86 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  45.53 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  45.53 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  45.9 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  52.59 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  43.85 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  49.18 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  47.45 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  56.57 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  52.17 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  46.46 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  44.62 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  52.59 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  46.03 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  45.38 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  42.5 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  46.03 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  45.74 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  42.06 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  46.4 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  50.86 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  46.61 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  46.48 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  48.41 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  45.24 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  41.73 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  41.73 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  40.48 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  40.46 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  50 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  40.46 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  44.88 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  45.69 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.54 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  42.52 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  44.26 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  40.77 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  43.51 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  39.37 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  45.83 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  47.01 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  45.08 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  40.6 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  40.6 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>