More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1420 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  77.78 
 
 		 158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  77.12 
 
 		 160 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  76.47 
 
 		 158 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  77.48 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  76.82 
 
 		 160 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  74.51 
 
 		 158 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  75.5 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  70.59 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  68.35 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  64.29 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  39.62 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  40.38 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.04 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  40.23 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  40.45 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  40.38 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  42.5 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  39.74 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  40 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  40.25 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  38.99 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  39.74 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  40.61 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  41.03 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  41.4 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  40.38 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  41.22 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  44.37 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  36.94 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  43.23 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  42.58 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  39.38 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  40.13 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  42.76 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  38.36 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  40.76 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  40.76 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  39.51 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  40.13 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  39.51 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  39.16 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.97 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  44.67 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  34.97 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  39.49 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  39.74 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  37.42 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  37.58 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  43.75 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  37.33 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  37.64 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  37.64 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  37.04 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  42.21 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  36.65 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  42.97 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  40.26 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  37.08 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  37.08 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  38.33 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  43.9 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  44.35 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  42.28 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  44.62 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  40.13 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  38.41 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  42.19 
 
 		 129 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  45.97 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  40.43 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  41.09 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  45.08 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.89 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  37.27 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  36.2 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  34.78 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  36.6 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  37.65 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  40.65 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>