183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1865 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  327  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  37.18 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  42.76 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  44.52 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.74 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  35.93 
 
 
169 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  40.76 
 
 
154 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  42.58 
 
 
168 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  37.42 
 
 
160 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  46.46 
 
 
129 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  41.25 
 
 
162 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  40.67 
 
 
163 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  38.61 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  37.91 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  33.75 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  37.01 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  38.31 
 
 
154 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  38.31 
 
 
154 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  38.31 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  38.85 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  44.44 
 
 
127 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  36.02 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  35.15 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  35.26 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  35.26 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  36.76 
 
 
132 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  36.94 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  42.65 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  44 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  33.75 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.89 
 
 
164 aa  89  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  47.58 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  35.62 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  32.69 
 
 
159 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.18 
 
 
161 aa  87  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  35.56 
 
 
175 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  35.56 
 
 
175 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  33.54 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  43.55 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  33.33 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  35.63 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  35.63 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  44 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  38.31 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  35.06 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  40.16 
 
 
138 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  37.27 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  43.2 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  37.27 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  42.98 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  42.19 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  41.79 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  46.15 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  46.15 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  46.34 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  42.31 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  32.89 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  33.96 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  37.65 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  38.4 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  34.15 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  38.31 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  34.38 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  38.71 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  38.71 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  33.13 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  40.31 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  37.01 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  33.74 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  38.56 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  39.83 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  41.86 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  37.01 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  36.6 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  34.18 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  38.64 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  35.06 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  40.5 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  38.03 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>