170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2653 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  295  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  64.23 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  59.2 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  60.94 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  60.16 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  59.26 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  56.39 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  53.19 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  58.02 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  56.93 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  56.2 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  60.32 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  57.14 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  54.41 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  54.55 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  57.38 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  56.8 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  57.5 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  55.65 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  55.47 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  57.98 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  48.61 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  51.15 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  47.92 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  53.03 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  53.03 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  56.25 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  51.13 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  51.13 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  52.1 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  49.31 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  42.96 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  48.09 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  51.85 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  48.09 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  42.22 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  42.22 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  47.33 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  42.22 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  42.19 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  50.41 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  50.76 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  50.76 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  48.82 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  51.49 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  46.15 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  46.43 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  47.54 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  46.27 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  52.07 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  48 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  48.76 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  45.9 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  45.8 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  44.96 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  45.74 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  48 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  47.2 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  40.32 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  44.96 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  45.08 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  45.08 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  44.96 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  43.61 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  44.8 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  47.86 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  46.4 
 
 		 157 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  45.52 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  45.6 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  46.1 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  41.43 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  43.07 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  45.6 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  39.69 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  43.31 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  44.63 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  42.31 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  41.46 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  41.8 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  43.8 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  39.06 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  44.8 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  46.34 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.61 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  38.28 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  40.94 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>