169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2841 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  97.93 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  94.48 
 
 		 145 aa  253  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  88.97 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  88.97 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  87.59 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  88.28 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  75 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  73.94 
 
 		 148 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  69.01 
 
 		 148 aa  199  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  73.94 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  76.06 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  73.61 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  54.29 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  55.32 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  55.32 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  53.47 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  54.48 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  56.45 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  54.81 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  51.75 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  54.41 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  51.82 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  48.61 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  53.28 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  48.91 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  50.36 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  53.57 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  57.02 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  53.04 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  49.25 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  47.14 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  46.43 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  47.1 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  46.38 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  47.86 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  41.55 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  45.19 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  43.07 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  40.82 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  38.73 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  38.73 
 
 		 168 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  40.85 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  38.03 
 
 		 168 aa  83.6  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  38.03 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  38.03 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  40.14 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  40.14 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  43.28 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  38.81 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  31.39 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  38.81 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  38.81 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  30.66 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  40.51 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  43.57 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  41.35 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  36.17 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  35.25 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  39.16 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  38.19 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  36.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  38.3 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  43.28 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  36.5 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  36.96 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  36.03 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  38.84 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  43.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  40.46 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  34.71 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  33.55 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  38.24 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  40.3 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  39.57 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  34.33 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  39.46 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  36.43 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  32.64 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  39.83 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  36.05 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  34.31 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  36.5 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>