168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4258 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  93.96 
 
 
149 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  74.47 
 
 
148 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  75 
 
 
145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  73.61 
 
 
145 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  75.18 
 
 
145 aa  201  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  70.21 
 
 
148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  72.22 
 
 
144 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  72.22 
 
 
144 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  72.22 
 
 
144 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  72.66 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  70.21 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  56.94 
 
 
141 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  52.35 
 
 
146 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  52.35 
 
 
146 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  48.3 
 
 
150 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  51.32 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  54.48 
 
 
129 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  55.65 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  56.2 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  52.41 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  57.04 
 
 
137 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  52.9 
 
 
136 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  53.57 
 
 
144 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  49.65 
 
 
129 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  57.39 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  54.31 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  47.83 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  46.72 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  50.72 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  43.42 
 
 
138 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  48.18 
 
 
142 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  47.83 
 
 
138 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  54.7 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  44.2 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  45.32 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  40.14 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  45.52 
 
 
121 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  42.03 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  41.3 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  39.71 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  40.56 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  44.12 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  42.11 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  38.06 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  38.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  38.81 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  39.86 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  39.72 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  39.86 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.31 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  41.14 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  42.11 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.31 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  38.06 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  37.31 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  39.42 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  41.98 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  35.77 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  39.39 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  31.16 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  37.96 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  38.13 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  29.93 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  40.15 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  37.68 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  42.62 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  41.38 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  29.79 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.61 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  35.77 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  35.56 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  38.41 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  35.29 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  38.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  40.28 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  39.16 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  34.85 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  37.59 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  38.13 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  32.9 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>