More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3796 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  100 
 
 
163 aa  339  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  51.9 
 
 
160 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  50.31 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  50 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  51.27 
 
 
161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  48.75 
 
 
162 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  47.83 
 
 
162 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  47.2 
 
 
164 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  46.58 
 
 
164 aa  157  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  46.84 
 
 
160 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  48.45 
 
 
166 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  51.23 
 
 
165 aa  153  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  49.06 
 
 
162 aa  147  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  46.31 
 
 
160 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  46.95 
 
 
165 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  45.12 
 
 
170 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  41.88 
 
 
156 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  41.4 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  41.4 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  44.3 
 
 
165 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  42.31 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  42.31 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  40.38 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  44.38 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  40.74 
 
 
162 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  44.3 
 
 
158 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  44.1 
 
 
155 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  39.41 
 
 
169 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  40.12 
 
 
158 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  41.82 
 
 
167 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  40.38 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  40.38 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  41.73 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  40.37 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  41.77 
 
 
157 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  38.75 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  38.75 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  38.75 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  39.75 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  38.12 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  39.1 
 
 
158 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  37.5 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  40.51 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  40.37 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  38.12 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  41.54 
 
 
131 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  46.83 
 
 
134 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  39.84 
 
 
128 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  36.08 
 
 
152 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  38.58 
 
 
129 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  37.34 
 
 
148 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  46.03 
 
 
140 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 
128 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  34.55 
 
 
177 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  40.16 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  42.4 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  37.97 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  34.71 
 
 
191 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  36.2 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  41.98 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  40.94 
 
 
132 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  33.54 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  40.94 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  40.94 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  36.24 
 
 
153 aa  91.3  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  40.94 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  34.13 
 
 
163 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  34.76 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  36.6 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  36.22 
 
 
126 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01838  hypothetical protein  41.73 
 
 
137 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  34.97 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  32.08 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  41.41 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  38.89 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  31.79 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  37.12 
 
 
143 aa  88.2  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  31.79 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  37.59 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  35.62 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  37.01 
 
 
135 aa  87.4  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  30.41 
 
 
183 aa  87  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  36.84 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>