167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2182 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  65.93 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  49.64 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  48.09 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  45.93 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  42.14 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  51.56 
 
 		 125 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  37.31 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  46.62 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  45.04 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  45.67 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  43.61 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  43.75 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  50.77 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  43.61 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  43.09 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  38.93 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  45.45 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  43.51 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  46.61 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  42.36 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  41.48 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  37.8 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  37.7 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  41.58 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  43.41 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  39.85 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  42.28 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  44.19 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  36.92 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  43.41 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  43.41 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  47.06 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  36.67 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  48.03 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  41.8 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  40.5 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  37.78 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  42.31 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  40.15 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  43.31 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  41.35 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  36.92 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  37.6 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  43.08 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  39.69 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.4 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  37.04 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  36.8 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  34.88 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  39.39 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  38.58 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  36.64 
 
 		 161 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  41.73 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  36.51 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  36.7 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  29.2 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  38.71 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  39.52 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  38.57 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  32.5 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  38.21 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  34.96 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  34.92 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  34.38 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  35.77 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36.57 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  34.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  35.66 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  39.85 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  35.77 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  39.25 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  40.38 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  30.3 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  38.28 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>