169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3524 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 128 aa  265  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  81.89 
 
 		 128 aa  224  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  79.53 
 
 		 129 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  66.14 
 
 		 131 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  45.38 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  43.41 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  43.08 
 
 		 164 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  45.8 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.75 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  42.97 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  42.4 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  40.31 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  42.86 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  39.84 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  37.21 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  43.75 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  38.4 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  37.6 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  42.4 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  38.62 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  38.62 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  44.26 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  44.8 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  39.37 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  37.93 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  34.96 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  37.4 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  43.44 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  41.86 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  42.62 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  37.01 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  42.62 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  40.98 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  41.13 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  39.2 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1547  ribosomal protein L20  36.09 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  36.29 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  37.24 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  37.24 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  36.43 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  36.29 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  37.6 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  41.8 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  41.8 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  35.51 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  37.4 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  38.24 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  40.77 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.21 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  37.69 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  35.43 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  34.11 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  34.11 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  40.16 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  35.04 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  36.51 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  39.37 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  35.16 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  35.66 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  36.89 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  36.36 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  35.66 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  35.48 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  37.69 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  35.94 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  39.06 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  34.43 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  36.72 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  34.78 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  34.85 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  32.03 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  35.54 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  32.35 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>