165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2064 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  387  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  74.33 
 
 		 187 aa  308  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  52.55 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  40.45 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  40.23 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  39.89 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  38.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  39.78 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  38.17 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  37.91 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  37.91 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  36.07 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  34.78 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  42.22 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  34.81 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  33.15 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  34.05 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  33.14 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  33.71 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  33.91 
 
 		 159 aa  94.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  32.14 
 
 		 158 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.67 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  33.67 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  33.16 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  33.52 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  35.03 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  33.16 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  33.16 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  35.88 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  30.41 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  31.22 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  32.22 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  34.44 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  32.57 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  32.77 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  31.05 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  32.05 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  32.4 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  33.89 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  30.86 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  32.6 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  33.52 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  33.52 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  29.83 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  29.84 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  30.9 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  30.94 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  34.59 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  29.47 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  29.95 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  31.93 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  36.94 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  29.11 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  33.14 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  33.55 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  35.66 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  29.21 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  31.82 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  29.41 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  31.36 
 
 		 155 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  36.92 
 
 		 128 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  28.57 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  35.37 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  35.56 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  36.43 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  30.19 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  29.41 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  32.45 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  35.44 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  30.51 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  38.06 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  30.29 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  29.89 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  35.26 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  28.99 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  33.77 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  31.87 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>