288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0708 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 110 aa  229  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  50.91 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  48.18 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  49.07 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  50.93 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  46.3 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  44.44 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  44.44 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  46.3 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  42.34 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  43.16 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.59 
 
 		 848 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  36.11 
 
 		 910 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1031 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 834 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1029 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 921 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 962 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 962 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 897 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  40 
 
 		 962 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 855 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  44.9 
 
 		 1136 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  64.52 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  52.17 
 
 		 800 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 869 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 858 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  30.33 
 
 		 910 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 1027 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 958 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 888 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  66.67 
 
 		 259 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  30.93 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  44.78 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  70.97 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1024 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 866 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  34.78 
 
 		 916 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 384 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  80.95 
 
 		 432 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 1017 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 896 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 957 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 535 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 276 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 276 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 845 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  32.99 
 
 		 894 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  33.33 
 
 		 859 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 900 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  55.26 
 
 		 858 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 836 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 864 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  63.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  32.04 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  38.81 
 
 		 897 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 1200 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 922 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 844 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 896 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  37.8 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  36.62 
 
 		 837 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  54.05 
 
 		 921 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 838 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  77.27 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  69.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  85 
 
 		 420 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 912 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  33.7 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 859 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  88.89 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  38.81 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 930 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  64.29 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 901 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 419 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 844 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 872 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 912 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  83.33 
 
 		 909 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  94.44 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  94.44 
 
 		 253 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>