More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2874 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  70.54 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  63.06 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  60.36 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 111 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  61.26 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  57.66 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  52.78 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  53.7 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  45.79 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  53.15 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  46.3 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  45.69 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  33.98 
 
 		 855 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 		 1027 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 888 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  34.29 
 
 		 894 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 844 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 896 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 838 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  35.14 
 
 		 944 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  52.78 
 
 		 267 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 272 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  32.46 
 
 		 910 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  46.48 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  52.78 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 912 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 384 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.43 
 
 		 962 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  45.07 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.43 
 
 		 962 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  82.61 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 845 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 896 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  69.23 
 
 		 432 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  61.76 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  32.43 
 
 		 962 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 897 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 800 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  71.43 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  60.61 
 
 		 848 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  51.11 
 
 		 1031 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  56.25 
 
 		 909 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  31.93 
 
 		 858 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  81.82 
 
 		 420 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  32.04 
 
 		 836 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 864 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 921 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 834 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  63.33 
 
 		 264 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 859 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  85 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  70.83 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  36.99 
 
 		 669 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 1017 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  31.93 
 
 		 906 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 535 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 235 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 		 939 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  58.06 
 
 		 225 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 859 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 319 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 239 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 957 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 419 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  34.12 
 
 		 904 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 958 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  28.07 
 
 		 915 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  34.12 
 
 		 904 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  66.67 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  36.05 
 
 		 906 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 378 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  34.12 
 
 		 904 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  30.36 
 
 		 908 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 922 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0831  hypothetical protein  36.23 
 
 		 869 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  77.27 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  38.82 
 
 		 903 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 910 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 872 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  41.38 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 921 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  81.82 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>