More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0831 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0831  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  44.06 
 
 		 822 aa  701    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2655  SEC-C motif domain protein  29.07 
 
 		 792 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3412  NERD domain-containing protein  19.51 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  38.71 
 
 		 239 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0159  hypothetical protein  23.06 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  65.71 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 901 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  58.14 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 901 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 901 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  76.92 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 901 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 901 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8691  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit-like protein  24.52 
 
 		 944 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.64 
 
 		 906 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 909 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  41.38 
 
 		 906 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 903 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  63.64 
 
 		 903 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 902 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  44.44 
 
 		 908 aa  56.2  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  56.41 
 
 		 958 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 842 aa  55.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 1067 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 1004 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 916 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  76.92 
 
 		 902 aa  55.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 916 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 939 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 896 aa  54.7  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 1113 aa  54.3  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 896 aa  54.3  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 907 aa  54.3  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 893 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 930 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 936 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 900 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 914 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 934 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 899 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 980 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 917 aa  53.9  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 915 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  53.85 
 
 		 970 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  53.85 
 
 		 970 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 914 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 931 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 944 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 934 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 934 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  53.5  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  77.27 
 
 		 923 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 909 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 907 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 936 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  64.52 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  37.93 
 
 		 992 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  36.78 
 
 		 921 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 936 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1118 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 931 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 907 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 970 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 908 aa  53.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 912 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 907 aa  53.5  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 911 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>