More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2556 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  91.3 
 
 		 161 aa  311  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0373  hypothetical protein  66.49 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3024  hypothetical protein  43.98 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  31 
 
 		 383 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2566  hypothetical protein  88.46 
 
 		 70 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  25.24 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  88.89 
 
 		 830 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 897 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  58.14 
 
 		 1136 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  82.14 
 
 		 884 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  80.77 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  48 
 
 		 845 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 858 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  34.88 
 
 		 894 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  49.06 
 
 		 834 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 864 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  57.45 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 844 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 866 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  31.52 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  60.98 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 838 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  59.46 
 
 		 888 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  35.37 
 
 		 535 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  73.08 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  38.75 
 
 		 162 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 909 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21380  SEC-C motif-containing protein  24.11 
 
 		 665 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  69.23 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 896 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 848 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 881 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  37.97 
 
 		 944 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  95.24 
 
 		 875 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 837 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  61.76 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  63.89 
 
 		 163 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 378 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  55.26 
 
 		 432 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  39.56 
 
 		 162 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 917 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 1118 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  52.38 
 
 		 836 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  76 
 
 		 923 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  78.26 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 921 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 859 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 921 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 912 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  33.72 
 
 		 922 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 842 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  70.83 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  36.99 
 
 		 1200 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  90 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  74.19 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  33.67 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  51.28 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  59.38 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 800 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 916 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  38.55 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  82.61 
 
 		 903 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 104 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 910 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 618 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  76 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  76 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 1277 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 902 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  62.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 909 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 906 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  81.82 
 
 		 585 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 488 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 904 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 872 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>