More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1588 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 383 aa  793    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  31 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  33.33 
 
 		 161 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  22.65 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  27.75 
 
 		 838 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  60.47 
 
 		 962 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  60.47 
 
 		 962 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  60.47 
 
 		 962 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  59.09 
 
 		 944 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  29.2 
 
 		 881 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  24.66 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1067 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 859 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  28.3 
 
 		 897 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  54.76 
 
 		 922 aa  56.6  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  35.71 
 
 		 834 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  30.83 
 
 		 888 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  51.16 
 
 		 1136 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 844 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 903 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 162 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 864 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  45.61 
 
 		 910 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  71.43 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  64.52 
 
 		 909 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 858 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 836 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  49.02 
 
 		 912 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3024  hypothetical protein  26.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 908 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  51.28 
 
 		 162 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  33.33 
 
 		 921 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  32.29 
 
 		 921 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 848 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 914 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 914 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 907 aa  53.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 858 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  42 
 
 		 917 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 845 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  52.78 
 
 		 902 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 872 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 912 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 907 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 911 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0373  hypothetical protein  25.14 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  62.86 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 910 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  68.75 
 
 		 1118 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 907 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 837 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  54.55 
 
 		 933 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  63.33 
 
 		 912 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 1024 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  68.97 
 
 		 214 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 535 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  55.26 
 
 		 170 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 836 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 833 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 842 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 907 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  33.68 
 
 		 135 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  64.52 
 
 		 156 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  48.94 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  48.94 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  48.94 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  47.73 
 
 		 844 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 916 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 907 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  62.5 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 1004 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  62.07 
 
 		 903 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  48 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  48.94 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 866 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 913 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  59.38 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 934 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 931 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  73.91 
 
 		 923 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 936 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 936 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 934 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>