More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3769 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 378 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  74.29 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  60.47 
 
 		 293 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  74.19 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  87.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 864 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 896 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 848 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  87.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  87.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 731 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 897 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 888 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  61.11 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 910 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 866 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  42.11 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 838 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  82.61 
 
 		 909 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  51.02 
 
 		 104 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 836 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 844 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 834 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  88 
 
 		 921 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 618 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 535 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  56.41 
 
 		 1277 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  74.07 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 894 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 1136 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  67.74 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 922 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 859 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 837 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  95.45 
 
 		 253 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 135 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 266 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 239 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  79.17 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 912 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  90.91 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 858 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 96 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 896 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 872 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 1200 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  62.5 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 904 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 899 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  43.4 
 
 		 875 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  81.48 
 
 		 1118 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  68.57 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 904 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 881 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  90 
 
 		 830 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 800 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 904 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 962 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 170 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 962 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  95 
 
 		 166 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 962 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 908 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 907 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1067 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  70.37 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 944 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 162 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 897 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 934 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 936 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 161 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  94.74 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 932 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 936 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 934 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  63.64 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 932 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  78.26 
 
 		 236 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>