More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2091 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  72.41 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 922 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  64.29 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 837 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  67.86 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 888 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  63.64 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 838 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  58.06 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 894 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  64.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 910 aa  49.7  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 992 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 1136 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 1277 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  85 
 
 		 875 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 912 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 845 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 836 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 161 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 864 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 909 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 914 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 914 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 949 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  61.29 
 
 		 585 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 731 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 859 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 844 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 859 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  59.26 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 535 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 848 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  85 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  85 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 921 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 901 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 881 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 897 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  78.26 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 		 933 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 731 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  77.27 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  65.38 
 
 		 421 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 916 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 855 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 958 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  59.38 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 939 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 1031 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 834 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1024 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 909 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 912 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 906 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  84.21 
 
 		 909 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 900 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  62.96 
 
 		 488 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  84.21 
 
 		 903 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  78.26 
 
 		 155 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 915 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  79.17 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 912 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  85 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  73.91 
 
 		 908 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 903 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1010 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 916 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 902 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 970 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 980 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  68 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>