More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2197 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
297 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 
277 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  50.53 
 
 
289 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  50.53 
 
 
289 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  56.91 
 
 
253 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  53.88 
 
 
273 aa  278  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
261 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  53.41 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  53.41 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
258 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  47.72 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 
261 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 
255 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  53.36 
 
 
255 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  53.04 
 
 
254 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  53.04 
 
 
254 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  54.07 
 
 
256 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 
255 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 
260 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 
284 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  51.63 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  51.22 
 
 
260 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  51.22 
 
 
255 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
260 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
277 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
260 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  50 
 
 
261 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51 
 
 
266 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  50 
 
 
261 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  51.22 
 
 
260 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  53.25 
 
 
262 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 
260 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
271 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
256 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.59 
 
 
267 aa  255  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  51.43 
 
 
263 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
260 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
270 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  51 
 
 
274 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  52.81 
 
 
279 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
258 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
270 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
276 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
277 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  50.2 
 
 
264 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
258 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
264 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
267 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
270 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  49.18 
 
 
262 aa  248  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
258 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
264 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
263 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
259 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
261 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
263 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  48.18 
 
 
259 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  43.36 
 
 
289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  50.83 
 
 
285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  48.61 
 
 
271 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  43.99 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
267 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  49 
 
 
271 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  50 
 
 
263 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
266 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  50.86 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
275 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
264 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  47.01 
 
 
293 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  47.01 
 
 
293 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  45.17 
 
 
276 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
278 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  42.25 
 
 
290 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  48.57 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>