More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0566 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
261 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  68.38 
 
 
261 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  68.99 
 
 
261 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  68.99 
 
 
261 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  64.98 
 
 
260 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  65.22 
 
 
258 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  64.59 
 
 
260 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  65.89 
 
 
260 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  65.5 
 
 
260 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  66.41 
 
 
256 aa  362  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
260 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
260 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  63.57 
 
 
260 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  63.57 
 
 
260 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  66.67 
 
 
267 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  64.48 
 
 
263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  63.04 
 
 
260 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  66.14 
 
 
258 aa  353  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  66.14 
 
 
270 aa  353  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  64.82 
 
 
254 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  64.43 
 
 
254 aa  352  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  63.86 
 
 
255 aa  349  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  63.14 
 
 
255 aa  348  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  64.96 
 
 
266 aa  344  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  62.31 
 
 
264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 
258 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  62.9 
 
 
284 aa  341  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  62.26 
 
 
262 aa  340  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  62.85 
 
 
266 aa  340  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  62.99 
 
 
269 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 
270 aa  338  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  62.6 
 
 
267 aa  338  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  61.75 
 
 
269 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  61.75 
 
 
269 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
258 aa  331  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
264 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
271 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  60.62 
 
 
259 aa  329  3e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
264 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  59.84 
 
 
253 aa  328  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
264 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
264 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
264 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
264 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  60.62 
 
 
259 aa  328  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  61.81 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  58.63 
 
 
253 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
271 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
271 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  61.2 
 
 
258 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 
271 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
271 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  64.98 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  59.53 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  59.04 
 
 
275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
269 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
263 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  58.57 
 
 
263 aa  318  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
263 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 
267 aa  318  6e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 
264 aa  318  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  56.88 
 
 
280 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
260 aa  316  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  59.14 
 
 
278 aa  316  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  58.75 
 
 
278 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  58.63 
 
 
261 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  61.36 
 
 
278 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  61.36 
 
 
278 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  60.98 
 
 
265 aa  315  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  59.46 
 
 
263 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 
270 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
274 aa  314  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  60.98 
 
 
278 aa  314  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  59.38 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  60.23 
 
 
265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  60.98 
 
 
265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  59.85 
 
 
266 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  61.51 
 
 
278 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
272 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>