More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2076 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  79.06 
 
 
277 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  71.79 
 
 
273 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  71.96 
 
 
274 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  70.96 
 
 
274 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  70.96 
 
 
274 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  68 
 
 
275 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  71.7 
 
 
284 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  72.32 
 
 
273 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  71.32 
 
 
274 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  71.11 
 
 
274 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  71.7 
 
 
284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  74.12 
 
 
274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  71.7 
 
 
279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  70.37 
 
 
274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  70.37 
 
 
271 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  70 
 
 
278 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  72.62 
 
 
274 aa  401  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  70.57 
 
 
275 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  66.79 
 
 
278 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  68.52 
 
 
278 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  68.15 
 
 
279 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  65.68 
 
 
275 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  65.68 
 
 
299 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  65.56 
 
 
275 aa  387  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  65.19 
 
 
279 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  65.44 
 
 
276 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  63 
 
 
276 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  66.04 
 
 
271 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  67.05 
 
 
283 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  63.97 
 
 
279 aa  360  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  63.37 
 
 
279 aa  359  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  65.75 
 
 
263 aa  355  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  60.74 
 
 
274 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  63.24 
 
 
261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 
269 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
293 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
293 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 
271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  59.77 
 
 
293 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  59.4 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  58.51 
 
 
261 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  61.51 
 
 
260 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  59.51 
 
 
260 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  61.51 
 
 
260 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  58.09 
 
 
261 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 
260 aa  314  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  59.2 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  57.2 
 
 
266 aa  311  4.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  57.49 
 
 
260 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  58.1 
 
 
259 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  58.1 
 
 
259 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  55.81 
 
 
262 aa  309  4e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  58.92 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  60.82 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  57.68 
 
 
256 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  57.89 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  57.43 
 
 
258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  56.76 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  58.53 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.44 
 
 
260 aa  300  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  53.88 
 
 
255 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  57.31 
 
 
266 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  59.02 
 
 
284 aa  298  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  56.08 
 
 
261 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  55.24 
 
 
258 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  55.24 
 
 
270 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 
258 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  56.7 
 
 
275 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  55.82 
 
 
269 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  55.82 
 
 
269 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  57.77 
 
 
270 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  57.37 
 
 
256 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  55.28 
 
 
268 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  53.94 
 
 
254 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.4 
 
 
268 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  53.94 
 
 
254 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  54.4 
 
 
268 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  54.4 
 
 
268 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  57.55 
 
 
266 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
269 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  56.35 
 
 
263 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  52.67 
 
 
266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  54.07 
 
 
268 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
264 aa  288  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  53.58 
 
 
267 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  59.27 
 
 
284 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
264 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  52.43 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 
272 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 
272 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  56.47 
 
 
262 aa  285  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 
272 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>