More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0733 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
271 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  66.04 
 
 
277 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  65.64 
 
 
273 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  66.03 
 
 
277 aa  363  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  66.28 
 
 
279 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  65.5 
 
 
263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  64.15 
 
 
276 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  62.31 
 
 
279 aa  351  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  64.5 
 
 
283 aa  350  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  63.46 
 
 
293 aa  347  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  63.46 
 
 
293 aa  347  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  63.88 
 
 
275 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  62.45 
 
 
279 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  64.31 
 
 
279 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  59.48 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  62.07 
 
 
260 aa  342  4e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  62.74 
 
 
274 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  65.06 
 
 
271 aa  341  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  63.67 
 
 
274 aa  341  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  62.12 
 
 
276 aa  341  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  62.26 
 
 
293 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  64.31 
 
 
278 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  62.41 
 
 
274 aa  339  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  62.17 
 
 
274 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 
261 aa  338  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  61.83 
 
 
274 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  64.2 
 
 
269 aa  337  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  62.5 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  61.57 
 
 
278 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 
278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  64.23 
 
 
284 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 
279 aa  335  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  61.36 
 
 
274 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  61.78 
 
 
274 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 
275 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 
299 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  62.74 
 
 
284 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  60.96 
 
 
259 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  62.4 
 
 
258 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  60.96 
 
 
259 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  59.16 
 
 
274 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  61.54 
 
 
271 aa  331  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  65.02 
 
 
276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 
274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 
273 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  60 
 
 
258 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  59.62 
 
 
266 aa  322  4e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  59.68 
 
 
256 aa  322  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  60.32 
 
 
263 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  60.69 
 
 
266 aa  321  8e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  62.1 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  58.27 
 
 
270 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  62.5 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  62.1 
 
 
260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  62.1 
 
 
260 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  59.36 
 
 
255 aa  319  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  59.22 
 
 
263 aa  318  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  61.29 
 
 
260 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  61.29 
 
 
260 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  60.48 
 
 
260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  57.69 
 
 
262 aa  311  6.999999999999999e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.68 
 
 
261 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.68 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  57.83 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  57.83 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.47 
 
 
260 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  58.47 
 
 
260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
275 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  57.43 
 
 
253 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  57.66 
 
 
261 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  57.68 
 
 
275 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  55.87 
 
 
260 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  56.18 
 
 
256 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  56 
 
 
255 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  55.87 
 
 
258 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.24 
 
 
258 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
268 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
268 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
268 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
270 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  56.59 
 
 
274 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  55.42 
 
 
268 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
267 aa  295  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  56.91 
 
 
266 aa  295  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
268 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  55.51 
 
 
269 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  57.56 
 
 
255 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  56.52 
 
 
261 aa  294  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  56.52 
 
 
261 aa  294  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  56.52 
 
 
261 aa  294  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>