More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1027 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  99.25 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  94.4 
 
 		 268 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  94.78 
 
 		 268 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  94.4 
 
 		 268 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  93.66 
 
 		 268 aa  520  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  90.67 
 
 		 268 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 273 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  73.9 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  71.84 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  70.68 
 
 		 263 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  69.64 
 
 		 270 aa  361  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  70.45 
 
 		 263 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  68.67 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  67.2 
 
 		 268 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  65.99 
 
 		 258 aa  348  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  67.08 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  65.32 
 
 		 265 aa  346  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  68.02 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  65.18 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  67.61 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  65.18 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  65.18 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  65.18 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  65.18 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  63.56 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  63.01 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.46 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.46 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  58.66 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.53 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  59.76 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  61.94 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  61.38 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  61.07 
 
 		 255 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 		 260 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 		 260 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  60.56 
 
 		 267 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  59.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  60.64 
 
 		 266 aa  317  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  57.36 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  57.53 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  56.45 
 
 		 256 aa  314  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  60.56 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  58.94 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  58.61 
 
 		 262 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  59.35 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  56.18 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  58.57 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  57.81 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  56.91 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  59.36 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  56.91 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  56.23 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  57.49 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  57.49 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  58.57 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  58.57 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  58.57 
 
 		 271 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  58.57 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  57.37 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  57.77 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  58.89 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  57.72 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  56.97 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  57.25 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  57.25 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>