More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0155 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  95.6 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  93.77 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  88.69 
 
 		 273 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  85.04 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  84.25 
 
 		 274 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  85.19 
 
 		 271 aa  488  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  70.85 
 
 		 275 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  71.96 
 
 		 277 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  70.59 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  70.22 
 
 		 277 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  67.15 
 
 		 278 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  68.86 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  67.65 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  67.65 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  66.42 
 
 		 275 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  66.42 
 
 		 299 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  66.3 
 
 		 275 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  69.37 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  66.67 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  64 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  64.02 
 
 		 279 aa  371  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  65.68 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  65.54 
 
 		 279 aa  368  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  63.5 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  62.88 
 
 		 274 aa  361  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  65.08 
 
 		 274 aa  361  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  64.04 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  62.74 
 
 		 284 aa  358  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  60.52 
 
 		 274 aa  358  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  60.74 
 
 		 275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  61.98 
 
 		 284 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  61.99 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  62.26 
 
 		 271 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  60.67 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  60.44 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  60.67 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  62.74 
 
 		 271 aa  342  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  60.67 
 
 		 269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  58.71 
 
 		 271 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  60.89 
 
 		 261 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.88 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.23 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  53.52 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  53.56 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  52.31 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  53.36 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  52.53 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.48 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  53.91 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  51.95 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  49.62 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 		 284 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  52.54 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  51.5 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  52.38 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  48.43 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  54.3 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  52.63 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  52.74 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  52.74 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  55.08 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.02 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  52.76 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  52.76 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  52.48 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 		 277 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.59 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  48.85 
 
 		 269 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>