More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4833 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  80.22 
 
 
283 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  78.18 
 
 
274 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  74.26 
 
 
279 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  64.1 
 
 
274 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  67.72 
 
 
263 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  66.28 
 
 
271 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  63.37 
 
 
274 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  62.41 
 
 
275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  64.04 
 
 
274 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  63.37 
 
 
277 aa  359  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  67.76 
 
 
261 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  63.74 
 
 
277 aa  358  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  65.3 
 
 
273 aa  358  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  61.9 
 
 
274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  63.3 
 
 
271 aa  355  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  61.99 
 
 
271 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  61.68 
 
 
279 aa  355  5.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  61.54 
 
 
279 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  61.54 
 
 
278 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  62.27 
 
 
274 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  63 
 
 
278 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  58.76 
 
 
276 aa  348  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  63.67 
 
 
273 aa  347  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  61.62 
 
 
274 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  61.54 
 
 
278 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  60.44 
 
 
275 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  59.49 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  59.49 
 
 
299 aa  341  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  61.72 
 
 
293 aa  338  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  61.72 
 
 
293 aa  338  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  61.33 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  61.33 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  61.9 
 
 
275 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 
269 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  60.69 
 
 
276 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  61.11 
 
 
279 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
284 aa  325  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 
284 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  57.84 
 
 
274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  59.13 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  56.37 
 
 
266 aa  309  4e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
266 aa  308  8e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  58.7 
 
 
260 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  58.3 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  59.09 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  56.97 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
260 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
261 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
261 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  58 
 
 
258 aa  298  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 
260 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  55.91 
 
 
259 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  55.91 
 
 
259 aa  298  9e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  54.58 
 
 
255 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  59.15 
 
 
260 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  56.2 
 
 
260 aa  297  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  59.15 
 
 
260 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
270 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  59.15 
 
 
260 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  55.87 
 
 
260 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
258 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 
260 aa  294  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  55.51 
 
 
271 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  56.69 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  56.3 
 
 
266 aa  292  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  55.28 
 
 
254 aa  291  8e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  55.28 
 
 
254 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51.14 
 
 
266 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  55.12 
 
 
267 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 
258 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  53.23 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  53.61 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  53.23 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  53.23 
 
 
271 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  53.61 
 
 
271 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
258 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  53.23 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  54.25 
 
 
270 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  55.79 
 
 
269 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  56.38 
 
 
270 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  53.01 
 
 
255 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  54.66 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  51.89 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  54.31 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 
275 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  54.05 
 
 
262 aa  285  8e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  52.45 
 
 
271 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  58.02 
 
 
267 aa  284  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  52.45 
 
 
271 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  55.97 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>