More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1273 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  100 
 
 
258 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  86.45 
 
 
258 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  85.04 
 
 
259 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  84.65 
 
 
259 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  73.2 
 
 
270 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  73.25 
 
 
263 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  70.52 
 
 
263 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  65.49 
 
 
258 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  67.45 
 
 
256 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 
261 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  69.05 
 
 
263 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
261 aa  362  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  67.32 
 
 
263 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  65.49 
 
 
255 aa  360  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  64.5 
 
 
269 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  66.67 
 
 
267 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  67.44 
 
 
270 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  66.53 
 
 
255 aa  359  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  64.31 
 
 
261 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  64.59 
 
 
264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
261 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  63.92 
 
 
258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  68.02 
 
 
268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  66.4 
 
 
260 aa  354  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  67.61 
 
 
268 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  67.61 
 
 
268 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  66.8 
 
 
268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  66.94 
 
 
274 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  64.73 
 
 
266 aa  352  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  63.92 
 
 
260 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  64.17 
 
 
254 aa  351  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 
260 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  64.17 
 
 
254 aa  350  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 
260 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 
260 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 
260 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 
260 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  66 
 
 
275 aa  348  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  63.92 
 
 
261 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 
261 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  67.21 
 
 
268 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
268 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 
260 aa  347  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  62.21 
 
 
267 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 
268 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  64.68 
 
 
268 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  63.95 
 
 
267 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  63.18 
 
 
266 aa  344  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  64.34 
 
 
271 aa  344  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  62.35 
 
 
260 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  65.48 
 
 
284 aa  343  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
273 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  64.4 
 
 
272 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  63.42 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  63.42 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  64.94 
 
 
263 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 
258 aa  341  5e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  63.35 
 
 
262 aa  341  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  62.89 
 
 
270 aa  341  7e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  63.95 
 
 
271 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  60.39 
 
 
264 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  62.31 
 
 
272 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  63.04 
 
 
275 aa  339  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  64.14 
 
 
263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  60 
 
 
264 aa  338  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  338  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  60.78 
 
 
263 aa  337  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  60.78 
 
 
263 aa  337  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 
264 aa  337  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
264 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
264 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
264 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
264 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
264 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  64.8 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  64.8 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  64.8 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  63.57 
 
 
271 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  61.89 
 
 
284 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>