More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2485 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  74.81 
 
 
263 aa  410  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  73.83 
 
 
275 aa  407  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
273 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  73.93 
 
 
272 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  73.11 
 
 
270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  71.21 
 
 
263 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  72.69 
 
 
263 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  73.88 
 
 
268 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  73.06 
 
 
268 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  73.47 
 
 
268 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  71.84 
 
 
268 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  72.65 
 
 
268 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  72.65 
 
 
268 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  67.84 
 
 
261 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  69.14 
 
 
261 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  71.84 
 
 
268 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  68.68 
 
 
263 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  68.63 
 
 
261 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  65.3 
 
 
268 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  67.55 
 
 
263 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
259 aa  359  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
259 aa  358  6e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  67.58 
 
 
261 aa  357  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  67.58 
 
 
261 aa  357  9e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  67.58 
 
 
261 aa  357  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  65.34 
 
 
265 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  66.94 
 
 
258 aa  352  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  66.94 
 
 
258 aa  348  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  63.52 
 
 
255 aa  337  9e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  62.35 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
260 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  62.65 
 
 
266 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  61.45 
 
 
270 aa  331  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  62.15 
 
 
284 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 
260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  62.25 
 
 
267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  61.29 
 
 
261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  60.48 
 
 
260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  60.66 
 
 
258 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  60.08 
 
 
260 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  61.79 
 
 
264 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  59.68 
 
 
260 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
267 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  61.48 
 
 
260 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  59.68 
 
 
260 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.43 
 
 
261 aa  321  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  59.27 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  60.41 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  60.64 
 
 
269 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.02 
 
 
261 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
271 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  60.16 
 
 
263 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  59.02 
 
 
260 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  58.1 
 
 
278 aa  315  5e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  58.47 
 
 
260 aa  314  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  60.41 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  60.82 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  57.71 
 
 
278 aa  312  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  58.06 
 
 
262 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  58.8 
 
 
272 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  57.89 
 
 
254 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  58.69 
 
 
266 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  57.49 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  59.04 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  59.44 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  58.63 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  59.04 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  58.63 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  58.63 
 
 
271 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  58.63 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  58.23 
 
 
269 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  57.83 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  57.72 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  59.5 
 
 
284 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  54.58 
 
 
264 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  57.03 
 
 
264 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  57.03 
 
 
264 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  54.58 
 
 
264 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  54.58 
 
 
264 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  54.58 
 
 
264 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  54.58 
 
 
264 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>