More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1044 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  69.32 
 
 
258 aa  384  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  69.92 
 
 
255 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  68.13 
 
 
261 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  65.76 
 
 
267 aa  363  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  63.81 
 
 
267 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  67.06 
 
 
263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  64.54 
 
 
254 aa  350  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  65.6 
 
 
264 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  63.28 
 
 
266 aa  350  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  64.54 
 
 
254 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  64.59 
 
 
267 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  62.79 
 
 
269 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  61.87 
 
 
270 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  63.42 
 
 
258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  63.6 
 
 
255 aa  342  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 
256 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  61.63 
 
 
260 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  61.57 
 
 
266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  62.55 
 
 
261 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  61.24 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  62.02 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  59.92 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  60.31 
 
 
271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  61.24 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  61.24 
 
 
260 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  61.09 
 
 
259 aa  334  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  60.08 
 
 
260 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  60.23 
 
 
272 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  60.85 
 
 
260 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  62.15 
 
 
261 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  61.75 
 
 
261 aa  332  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 
258 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  60.71 
 
 
270 aa  328  4e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  60.85 
 
 
260 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  60.7 
 
 
278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
263 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  59.3 
 
 
260 aa  324  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  59.69 
 
 
272 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  60.63 
 
 
284 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  59.53 
 
 
278 aa  322  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  59.92 
 
 
258 aa  321  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  59.62 
 
 
284 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  61.09 
 
 
271 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  60.31 
 
 
271 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  60.31 
 
 
271 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  59.29 
 
 
274 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  60.7 
 
 
271 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  60.31 
 
 
271 aa  317  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  57.98 
 
 
275 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  60.31 
 
 
271 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
270 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  58.85 
 
 
262 aa  315  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  59.6 
 
 
260 aa  315  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
275 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  58.89 
 
 
274 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  59.52 
 
 
258 aa  315  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  61 
 
 
276 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  54.92 
 
 
275 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  57.37 
 
 
265 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 
261 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  54.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  56.15 
 
 
261 aa  308  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  57.59 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  57.53 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  57.2 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
264 aa  305  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  57.71 
 
 
276 aa  305  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
268 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  55.21 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 
268 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  57.49 
 
 
266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  54.62 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>