More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1434 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  91.18 
 
 		 272 aa  527  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  82.78 
 
 		 275 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  84.19 
 
 		 274 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  83.46 
 
 		 274 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  77.86 
 
 		 270 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  80.77 
 
 		 271 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  80.38 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  78.46 
 
 		 278 aa  438  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  77.69 
 
 		 278 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  78.11 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  78.11 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  76.75 
 
 		 271 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  77.36 
 
 		 271 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  78.11 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  76.75 
 
 		 271 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  78.11 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  71.64 
 
 		 267 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  75.09 
 
 		 269 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  75.46 
 
 		 269 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  72.56 
 
 		 269 aa  407  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  70.68 
 
 		 266 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  69.06 
 
 		 266 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  67.42 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  65.57 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  67.68 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  67.88 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  68.89 
 
 		 271 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  68.89 
 
 		 271 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  67.41 
 
 		 271 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  63.5 
 
 		 274 aa  358  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  61.65 
 
 		 275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  65.3 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 260 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  61.83 
 
 		 260 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  62.07 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 260 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  65.19 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  61.83 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  63.42 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  60.54 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  62.31 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  62.26 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  63.7 
 
 		 276 aa  338  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  61.83 
 
 		 261 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  61.45 
 
 		 261 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  64.31 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  62.85 
 
 		 284 aa  334  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  61.09 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  61.09 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  61.07 
 
 		 261 aa  331  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  61.54 
 
 		 255 aa  329  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  60.08 
 
 		 258 aa  329  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  59.22 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  61.18 
 
 		 258 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  60.39 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  59.22 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  61.35 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  59.22 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  59.53 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  59.3 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  59.3 
 
 		 258 aa  315  7e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  61.26 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  58.8 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  59.26 
 
 		 268 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  59.26 
 
 		 268 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  59.04 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 266 aa  308  9e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  55.89 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  59.09 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  57.58 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  55.89 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  56.65 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  57.81 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  56.27 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  55.97 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  55.97 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  55.97 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  55.97 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  55.97 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>