More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1581 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  87.45 
 
 
271 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  87.41 
 
 
271 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  76.87 
 
 
284 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  80.81 
 
 
276 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  75.64 
 
 
274 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  72.28 
 
 
275 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  70.26 
 
 
267 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  68.89 
 
 
272 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  71.59 
 
 
267 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  66.3 
 
 
272 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  72.76 
 
 
277 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  67.16 
 
 
267 aa  374  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  66.18 
 
 
275 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  67.05 
 
 
269 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  66.79 
 
 
270 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  69.08 
 
 
271 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  65.54 
 
 
274 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  66.29 
 
 
274 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  67.56 
 
 
271 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  67.67 
 
 
266 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 
278 aa  360  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  63.67 
 
 
278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  65.17 
 
 
266 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  68.89 
 
 
269 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  68.52 
 
 
269 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  68.42 
 
 
271 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  66.54 
 
 
276 aa  343  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  68.05 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  67.29 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  67.29 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  67.29 
 
 
271 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  67.29 
 
 
271 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  67.29 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  60 
 
 
258 aa  315  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  59.38 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  61.33 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  61.33 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  61.33 
 
 
260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  60.08 
 
 
260 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
284 aa  310  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  59.7 
 
 
258 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  57.47 
 
 
269 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  57.47 
 
 
269 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  59.09 
 
 
268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  59.09 
 
 
268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  59.09 
 
 
268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  58.78 
 
 
268 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 
268 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.91 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  59.23 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  58.98 
 
 
261 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 
279 aa  301  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
259 aa  301  9e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
259 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 
261 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.77 
 
 
261 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  56.23 
 
 
268 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.77 
 
 
261 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  59.77 
 
 
260 aa  298  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  56.92 
 
 
255 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  56.23 
 
 
268 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
256 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  58.04 
 
 
260 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  56.98 
 
 
260 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  55.47 
 
 
264 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  55.43 
 
 
271 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  52.83 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  56.69 
 
 
270 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  55.81 
 
 
260 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  55.76 
 
 
264 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  55.76 
 
 
264 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  55.76 
 
 
264 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  55.76 
 
 
264 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  55.76 
 
 
264 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
275 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  55.78 
 
 
274 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  55.47 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  55.47 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  53.52 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  56.25 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>