More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0653 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  90.42 
 
 
261 aa  497  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  89.27 
 
 
261 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  70.27 
 
 
263 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  69.14 
 
 
270 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  68.73 
 
 
263 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  69.14 
 
 
274 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  67.44 
 
 
263 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  64.48 
 
 
265 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  68.5 
 
 
263 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  68.27 
 
 
258 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  67.19 
 
 
263 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  66.41 
 
 
259 aa  362  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  66.41 
 
 
259 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
268 aa  358  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  65.87 
 
 
258 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  64.54 
 
 
275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
273 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
272 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
268 aa  351  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  67.21 
 
 
268 aa  351  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  66.4 
 
 
268 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
268 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
268 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  65.18 
 
 
268 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 
268 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
256 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  62.75 
 
 
261 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  62.35 
 
 
261 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  65.4 
 
 
261 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  65.4 
 
 
261 aa  339  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  61.96 
 
 
260 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  65.4 
 
 
261 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
267 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
260 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  61.07 
 
 
260 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
260 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
260 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  61.04 
 
 
258 aa  332  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  60.15 
 
 
260 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  61.85 
 
 
258 aa  331  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  60.78 
 
 
260 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  59.92 
 
 
255 aa  330  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  61.18 
 
 
260 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  60.78 
 
 
260 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 
284 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  61.04 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  60.64 
 
 
254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  58.71 
 
 
266 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
271 aa  321  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
264 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  58.43 
 
 
264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 
269 aa  316  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  60.96 
 
 
263 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
264 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 
267 aa  315  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  59.2 
 
 
270 aa  315  5e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  59.2 
 
 
258 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
271 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
269 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
263 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
269 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  57.25 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  57.43 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  58.96 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  56.82 
 
 
267 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  57.65 
 
 
275 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 
264 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  56.85 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>