More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01371 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  84.03 
 
 
263 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  72.35 
 
 
262 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  70.38 
 
 
260 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  70.66 
 
 
270 aa  381  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  70.66 
 
 
258 aa  381  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  71.37 
 
 
254 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  71.37 
 
 
254 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  69.5 
 
 
260 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  71.32 
 
 
256 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  68.73 
 
 
260 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  70.82 
 
 
255 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  68.24 
 
 
258 aa  377  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  68.36 
 
 
261 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  68.46 
 
 
260 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  68.46 
 
 
260 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  69.5 
 
 
260 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 
261 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  68.85 
 
 
260 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  68.46 
 
 
260 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  68.08 
 
 
260 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  66.15 
 
 
261 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  66.93 
 
 
255 aa  364  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  66.01 
 
 
266 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  67.83 
 
 
258 aa  359  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  64.57 
 
 
269 aa  359  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  63.36 
 
 
270 aa  357  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  64.96 
 
 
267 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  64.59 
 
 
258 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  64.17 
 
 
271 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  68.83 
 
 
284 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  64.84 
 
 
266 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  66.54 
 
 
267 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  64.91 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  64.57 
 
 
266 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  65.6 
 
 
269 aa  350  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  65.6 
 
 
269 aa  350  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  64.91 
 
 
263 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  62.6 
 
 
271 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  65.61 
 
 
259 aa  347  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
263 aa  347  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  65.1 
 
 
274 aa  347  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  65.1 
 
 
274 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  65.22 
 
 
259 aa  346  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
264 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
264 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
264 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  62.07 
 
 
272 aa  345  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
264 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  64.53 
 
 
264 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
264 aa  345  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
264 aa  345  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  61.87 
 
 
278 aa  344  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  63.78 
 
 
267 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  64.06 
 
 
275 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 
278 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  63.4 
 
 
264 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  62.31 
 
 
261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  62.64 
 
 
264 aa  342  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  62.75 
 
 
272 aa  342  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  61.89 
 
 
264 aa  341  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 
264 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  65.75 
 
 
253 aa  338  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  61.13 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  63.33 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  63.33 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  61.74 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  64.57 
 
 
253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  62.99 
 
 
271 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  62.7 
 
 
258 aa  335  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  64.98 
 
 
276 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  62.96 
 
 
278 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  62.59 
 
 
265 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  63.33 
 
 
265 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  63.57 
 
 
265 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  64.07 
 
 
266 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  63.1 
 
 
278 aa  328  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  61.48 
 
 
265 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  62.2 
 
 
271 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
271 aa  325  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 
269 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  61.4 
 
 
268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>