More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2941 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  80.36 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  77.12 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  76 
 
 		 276 aa  427  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  75.64 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  75.64 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  73.63 
 
 		 271 aa  407  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  70 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  72.22 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  68.01 
 
 		 267 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  68.54 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  65.8 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  63.7 
 
 		 269 aa  367  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  64.58 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  63.6 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  65.53 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  63.33 
 
 		 266 aa  358  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  63.5 
 
 		 272 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  64.47 
 
 		 269 aa  357  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  64.1 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  65.06 
 
 		 271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  61.68 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  62.36 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  61.62 
 
 		 274 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  63.57 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  62.5 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  62.5 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  63.2 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  61.17 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  62.83 
 
 		 271 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  62.83 
 
 		 271 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  62.91 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  57.56 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  60.08 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  57.88 
 
 		 278 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  60.62 
 
 		 261 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 		 258 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  60.62 
 
 		 261 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  59.77 
 
 		 268 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  59.62 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  58.98 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  57.36 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  58.62 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  57.03 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.69 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  57.47 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  57.81 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 		 268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  56.27 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  58.69 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  57.75 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  56.7 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  56.32 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  56.7 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  56.7 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  57.92 
 
 		 256 aa  301  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  58.14 
 
 		 284 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  54.2 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  54.41 
 
 		 264 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  54.2 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  56.59 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  56.85 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  56.59 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  55.21 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  56.37 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  56.64 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  55.98 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  54.83 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  55.21 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  56.49 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 		 258 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  52.96 
 
 		 275 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  56.13 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  52.94 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  52.94 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>