More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0969 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
277 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 
297 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
284 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
263 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
273 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  52.07 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  52.07 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 
261 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 
276 aa  271  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
268 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  52.78 
 
 
271 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
268 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 
261 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
268 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  53.6 
 
 
258 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.99 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  52.59 
 
 
266 aa  268  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 
274 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  52.19 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 
275 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 
274 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  52.61 
 
 
268 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
273 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
272 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  52.61 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  53.25 
 
 
261 aa  266  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  52.61 
 
 
268 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  54.11 
 
 
261 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
263 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  52.61 
 
 
268 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52 
 
 
259 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 
274 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  51.43 
 
 
255 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  49.8 
 
 
255 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  51.6 
 
 
259 aa  265  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
270 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  54.07 
 
 
260 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 
277 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 
260 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.03 
 
 
258 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
256 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  52.38 
 
 
277 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.82 
 
 
274 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  52.44 
 
 
264 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.82 
 
 
258 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
279 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  54.18 
 
 
271 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
274 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.82 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
274 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 
253 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 
253 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  50.99 
 
 
269 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
258 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  50.99 
 
 
269 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  51.2 
 
 
261 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51 
 
 
266 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 
274 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  51.2 
 
 
261 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  51.2 
 
 
261 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  51.22 
 
 
254 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
283 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  51.22 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
260 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
273 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  54.8 
 
 
274 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  51 
 
 
269 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  52.82 
 
 
255 aa  258  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
262 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
271 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  53.66 
 
 
253 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3362  methionine aminopeptidase, type I  47.33 
 
 
270 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 
263 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
275 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  54.18 
 
 
269 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
271 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
268 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>