More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3362 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3362  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
270 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  58.94 
 
 
289 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  58.56 
 
 
289 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1733  putative methionine aminopeptidase  55.6 
 
 
266 aa  307  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  50.56 
 
 
289 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  50.75 
 
 
291 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  48.67 
 
 
294 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  49.43 
 
 
294 aa  286  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  53.69 
 
 
258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  51.43 
 
 
256 aa  278  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  53.91 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  53.91 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  47.17 
 
 
290 aa  271  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  50.82 
 
 
260 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  48.16 
 
 
255 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
270 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.02 
 
 
258 aa  262  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  51.03 
 
 
253 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  50.63 
 
 
256 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50 
 
 
258 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
255 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  49.18 
 
 
260 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 
266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  49.18 
 
 
261 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
258 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  47.33 
 
 
277 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  48.59 
 
 
267 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  49.18 
 
 
261 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
260 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
260 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  50.82 
 
 
260 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  49.38 
 
 
277 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  254  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  49.37 
 
 
262 aa  254  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  51.23 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  49 
 
 
266 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  49.18 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
262 aa  251  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  46.99 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  48.36 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  48.98 
 
 
284 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  48.56 
 
 
261 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  50.2 
 
 
254 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  50.2 
 
 
254 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
279 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  47.95 
 
 
263 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
259 aa  249  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 
267 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
259 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  47.74 
 
 
261 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  46.91 
 
 
261 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  47.54 
 
 
263 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  49.79 
 
 
279 aa  248  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  47.13 
 
 
258 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  47.95 
 
 
255 aa  248  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  47.95 
 
 
264 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  47.74 
 
 
261 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
267 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
264 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
264 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  48 
 
 
265 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
264 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  49.37 
 
 
271 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
283 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
264 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  48.19 
 
 
270 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 
264 aa  247  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.77 
 
 
264 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  48.97 
 
 
275 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 
264 aa  246  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  47.6 
 
 
278 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  47.54 
 
 
264 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  46.31 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  50.21 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  45.9 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  46.72 
 
 
285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
270 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  48.15 
 
 
274 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  47.54 
 
 
267 aa  244  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 
278 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  47.39 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  47.2 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  47.2 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  47.76 
 
 
253 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  45.08 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  46.91 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  45.15 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
278 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 
271 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  45.08 
 
 
264 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  48 
 
 
265 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  46.62 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>