More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3439 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 289 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  61.25 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  61.59 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  55.28 
 
 		 294 aa  342  5e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  53.33 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3362  methionine aminopeptidase, type I  50.56 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1733  putative methionine aminopeptidase  49.81 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491997  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  54.18 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 		 258 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  53.25 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  53.66 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  53.66 
 
 		 260 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  53.66 
 
 		 260 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  53.66 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  50.41 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  48.18 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  52.03 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  49 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  47.77 
 
 		 253 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  43.36 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 284 aa  244  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  48.61 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 255 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0240  methionine aminopeptidase  44.98 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  49.38 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  49.59 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  49.59 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  47.92 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  47.92 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  48.02 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  48.63 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  49 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  47.37 
 
 		 260 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 		 262 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  51.82 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  48.39 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  50.63 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>