More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0292 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  100 
 
 		 332 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  66.87 
 
 		 334 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  65.96 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  28.32 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  25.37 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  25.66 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1472  hypothetical protein  24.41 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0409  hypothetical protein  29.28 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.550319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2235  hypothetical protein  27.41 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.271057  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 921 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  65.52 
 
 		 731 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 888 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 1031 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  55.26 
 
 		 731 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 864 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 910 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 837 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 848 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 836 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 897 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  67.86 
 
 		 104 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 866 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 845 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  80.95 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 921 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 378 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 922 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 881 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  43.08 
 
 		 585 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 838 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 912 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 834 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 894 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 844 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 1136 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  80 
 
 		 909 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 535 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 96 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 844 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 1277 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  55.56 
 
 		 875 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  77.27 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  68 
 
 		 830 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 859 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  72.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 858 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 161 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  85 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 1200 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  80.95 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 914 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 872 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 135 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  76.19 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 932 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 957 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 488 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 896 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 912 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 910 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  84.21 
 
 		 908 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 914 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 958 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  85 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 909 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>