12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0409 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.550319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2235  hypothetical protein  44.58 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.271057  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  37.66 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  34.5 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  33.45 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1472  hypothetical protein  33.1 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2645  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  29.28 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  27.3 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  28.96 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5557  hypothetical protein  25.14 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.96 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>