288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0468 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 334 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  91.62 
 
 		 334 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  65.96 
 
 		 332 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  28.57 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  26.76 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  26.61 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1472  hypothetical protein  26.32 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0409  hypothetical protein  28.96 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.550319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2235  hypothetical protein  29.7 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.271057  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  36.92 
 
 		 96 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2351  hypothetical protein  77.27 
 
 		 66 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 1277 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  41.79 
 
 		 731 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  73.91 
 
 		 731 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 897 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 836 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  80.95 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 888 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  73.91 
 
 		 228 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  77.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 866 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  77.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 896 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  77.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  77.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  67.74 
 
 		 457 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  41.18 
 
 		 104 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  77.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 837 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 1200 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  65.22 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 593 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  65.22 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 421 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 864 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 910 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.62 
 
 		 875 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 848 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  65.22 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  85 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 837 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  69.57 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  80 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 834 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  80.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  85.71 
 
 		 167 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 231 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  80 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 838 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  60.71 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 922 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  80 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 844 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 858 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 1029 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 859 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  80 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  76.19 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 912 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  65.22 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  80 
 
 		 167 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 909 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  68.18 
 
 		 239 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 894 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 1113 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 800 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  76.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  83.33 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 845 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  66.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  66.67 
 
 		 830 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  65.38 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 1031 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>