More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2780 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4265  hypothetical protein  28.76 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172907  normal  0.366814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  76.92 
 
 		 908 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 910 aa  55.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  35.44 
 
 		 1102 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 836 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  77.78 
 
 		 1200 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  32.73 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 844 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  58.82 
 
 		 842 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 864 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  55.81 
 
 		 896 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  53.19 
 
 		 848 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 920 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 912 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 945 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  60.53 
 
 		 432 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  74.07 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 1277 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 838 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  95 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  86.96 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 888 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 917 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  43.64 
 
 		 872 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 906 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 837 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 866 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  38.1 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 896 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 896 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 104 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 881 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  58.97 
 
 		 944 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 834 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  27.17 
 
 		 902 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  53.19 
 
 		 837 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2351  hypothetical protein  68.97 
 
 		 66 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  56.25 
 
 		 917 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  58.97 
 
 		 962 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 858 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  83.33 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 833 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  81.82 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  90 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  66.67 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 894 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 897 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  69.23 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  70.37 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  58.97 
 
 		 962 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  62.07 
 
 		 61 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  58.97 
 
 		 962 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  48.84 
 
 		 921 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  48.84 
 
 		 912 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  43.4 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 865 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 859 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  43.4 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 896 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 916 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  72.41 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 535 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  63.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  79.17 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  62.16 
 
 		 593 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  29.92 
 
 		 914 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 922 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  29.92 
 
 		 914 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 924 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  68.97 
 
 		 162 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 930 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 1004 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  65.38 
 
 		 901 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>