More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2814 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  46.77 
 
 		 922 aa  60.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  43.64 
 
 		 1200 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  45.61 
 
 		 917 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 837 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  50 
 
 		 903 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  46.55 
 
 		 848 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 896 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  70.37 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  46.15 
 
 		 910 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 912 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 897 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  64.71 
 
 		 800 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 842 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 917 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 896 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 909 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 907 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 888 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 907 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 593 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 838 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 864 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  55.88 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 907 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 911 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 872 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 907 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 858 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 		 881 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 925 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  48.78 
 
 		 834 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  68.97 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 384 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  63.33 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  62.5 
 
 		 901 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  44.83 
 
 		 858 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 837 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  86.96 
 
 		 419 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 962 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 962 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  50 
 
 		 962 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  71.43 
 
 		 908 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 921 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 980 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  73.08 
 
 		 239 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 836 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 908 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 1136 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 913 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 1113 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 916 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 535 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 866 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  65.62 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 944 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  65.52 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  62.07 
 
 		 859 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  68.97 
 
 		 909 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  62.07 
 
 		 291 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  53.66 
 
 		 264 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 833 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 909 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  58.82 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  67.86 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  68.75 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  64.71 
 
 		 923 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 894 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  69.23 
 
 		 993 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  63.16 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  43.75 
 
 		 939 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  66.67 
 
 		 830 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  80.95 
 
 		 420 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 1118 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  61.29 
 
 		 909 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 906 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  52.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  61.29 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 921 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 1031 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  52.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  52.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  52.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  42.5 
 
 		 421 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  56.25 
 
 		 958 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 902 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 1004 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  61.76 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  52.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  58.06 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 957 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>