More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1445 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 419 aa  838    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  77.42 
 
 		 160 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 		 844 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 896 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  77.42 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  67.5 
 
 		 1136 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  78.12 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 888 aa  56.6  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  84 
 
 		 848 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 837 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  38.1 
 
 		 921 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  91.3 
 
 		 922 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  60.47 
 
 		 945 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 910 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  88 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  75 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 912 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 957 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 958 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  86.96 
 
 		 800 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  86.96 
 
 		 909 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  65.71 
 
 		 1118 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 866 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  30.86 
 
 		 162 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  63.16 
 
 		 239 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 837 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  38.1 
 
 		 921 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 864 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  80.77 
 
 		 166 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 844 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  74.19 
 
 		 264 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  65.62 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  61.54 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 836 aa  53.1  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  57.5 
 
 		 830 aa  53.5  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 909 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  78.57 
 
 		 160 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  36.73 
 
 		 843 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  36.73 
 
 		 843 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 859 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 834 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  63.89 
 
 		 845 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 897 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 160 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  95.45 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 858 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  71.88 
 
 		 170 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  80.77 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 881 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 897 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 161 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 917 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 1031 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  86.96 
 
 		 61 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 910 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 907 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  70.59 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 869 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 1113 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 1200 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 899 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  47.5 
 
 		 980 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  66.67 
 
 		 909 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 900 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 908 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  58.82 
 
 		 902 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 908 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 908 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 936 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 907 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>