More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 535 aa  1111    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21380  SEC-C motif-containing protein  23.28 
 
 		 665 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  65.71 
 
 		 881 aa  58.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  91.67 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 866 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 837 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  81.48 
 
 		 909 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 910 aa  57.4  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  55.32 
 
 		 800 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  58.54 
 
 		 912 aa  57.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 848 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 1136 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 838 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 836 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 872 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  59.09 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  95.24 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 922 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 834 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 921 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  90.91 
 
 		 830 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 844 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 894 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 859 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  88 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 904 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 1200 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 904 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 858 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 904 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 1031 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  52.17 
 
 		 235 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 910 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  81.48 
 
 		 151 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  100 
 
 		 253 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  33.64 
 
 		 916 aa  54.3  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 845 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  90.48 
 
 		 228 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 896 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  95.45 
 
 		 162 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 897 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  90.91 
 
 		 166 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  62.86 
 
 		 168 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 901 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 900 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 901 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  95.24 
 
 		 228 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 901 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 901 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  35.37 
 
 		 239 aa  53.9  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  28.45 
 
 		 272 aa  53.9  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 901 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 1277 aa  53.9  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  54.76 
 
 		 276 aa  53.9  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  52.27 
 
 		 283 aa  53.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  95.24 
 
 		 135 aa  53.5  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 897 aa  53.9  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 378 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  80 
 
 		 249 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  54.76 
 
 		 276 aa  53.9  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  48.98 
 
 		 896 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 901 aa  53.5  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 916 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  80 
 
 		 166 aa  53.5  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 907 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  95.24 
 
 		 593 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  53.19 
 
 		 914 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 842 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 934 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 957 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 936 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 932 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  65.62 
 
 		 291 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 908 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 936 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 907 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  40.85 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 932 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 932 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 1004 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 170 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 908 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>