More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1429 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 384 aa  785    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2167  SEC-C motif domain protein  38.24 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  50.85 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  47.37 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  88.46 
 
 		 864 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  47.27 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  48.21 
 
 		 837 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  42.05 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  57.78 
 
 		 844 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 1113 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 897 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  53.33 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  76.67 
 
 		 897 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  84.62 
 
 		 859 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  53.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  53.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  53.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  53.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  61.9 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 866 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  42.42 
 
 		 858 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  78.57 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  77.42 
 
 		 888 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  45 
 
 		 896 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  52 
 
 		 834 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  50.88 
 
 		 900 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  88.89 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 958 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  78.57 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  84 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  52.63 
 
 		 916 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  61.36 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  84.62 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  58.7 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  73.33 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  44.59 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  88.46 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 838 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  41.56 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 1136 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  54.17 
 
 		 916 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  74.19 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 939 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  95.45 
 
 		 135 aa  57  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  55.56 
 
 		 800 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 912 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 936 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  95.24 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  46.27 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  67.65 
 
 		 593 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 1200 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 915 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 936 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  74.07 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  55.56 
 
 		 156 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 910 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 944 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1004 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 930 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 907 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  71.43 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 1277 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  59.46 
 
 		 909 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 912 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 845 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  61.9 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 908 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 917 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  80.77 
 
 		 962 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  100 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  49.06 
 
 		 618 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 962 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 911 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  91.3 
 
 		 257 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 908 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 907 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 908 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>