More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4386 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4386  transporter  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  42.86 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  39.38 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  40.09 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  32.07 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  30.09 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  32.79 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  32.79 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  31.7 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  33.94 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  28.69 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  28.45 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  28.45 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  29 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.7 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  29.02 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  30.53 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  28.94 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  78.57 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 864 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.06 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.25 
 
 		 1136 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  51.06 
 
 		 838 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  48 
 
 		 897 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 896 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 848 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 		 866 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  35.19 
 
 		 845 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 858 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  78.57 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 836 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  64.86 
 
 		 888 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  91.3 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  27.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.96 
 
 		 618 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  27.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  26.1 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 834 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  74.19 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  28.14 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  67.65 
 
 		 800 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  67.57 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  95.65 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  27.66 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 881 aa  55.1  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  56.82 
 
 		 842 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 949 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 910 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  65.79 
 
 		 921 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  27.82 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  83.33 
 
 		 909 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  25.94 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 844 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 859 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 535 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 593 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 421 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 922 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  62.5 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 916 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 894 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 930 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  64.71 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 896 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 905 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 837 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  90.91 
 
 		 167 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 912 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  46.81 
 
 		 945 aa  52.8  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  64.29 
 
 		 1277 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  95 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  41.79 
 
 		 1067 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  68.97 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 837 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  33.77 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  90.48 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 912 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 909 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  74.07 
 
 		 830 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 923 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 162 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 1118 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 1200 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 951 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1031 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>