71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1273 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  42.79 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  40.5 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  39.6 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  40 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  41.5 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  31.66 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  37.62 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  35.5 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  35.5 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  35.71 
 
 		 432 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  32.65 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  32.68 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  29.74 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  32.68 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  30.05 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  29.74 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  29.74 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  28.87 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  27 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  34.11 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30.65 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  28.5 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  30.7 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  26.06 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  27.03 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  35 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  34.41 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  23.96 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  27.14 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  29.83 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  28.57 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  28.04 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  28.73 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  28.37 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  28.37 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  26.87 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  26.87 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  29.41 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  26.87 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  26.87 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  27.45 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  27.18 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  26.98 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  26.98 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  27.69 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  26.98 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  25.52 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  26.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  26.15 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  28.74 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  26.46 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  25.55 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  25.13 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  28.43 
 
 		 272 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  28.57 
 
 		 189 aa  42  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  37.04 
 
 		 257 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  26.94 
 
 		 253 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>