65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0113 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  57.14 
 
 		 198 aa  238  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  54.36 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  43.81 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  41.97 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  36.84 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  31.94 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  30.27 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  31.12 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  31.12 
 
 		 267 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  31.32 
 
 		 432 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  33.51 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  28.57 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  29.29 
 
 		 336 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  29.29 
 
 		 336 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  28.42 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  29.15 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  29.15 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  27.08 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  27.89 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  26.74 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  26.32 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  27.72 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  28.72 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  29.63 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  28.23 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  29.21 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  29.23 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  26.88 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  23.48 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.07 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  22.99 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  26.34 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  26.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  27.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  26.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  27.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  26.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  26.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  23.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  23.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  23.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  23.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  23.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  24.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  24.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  24.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  24.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  26.47 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  27.32 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  23.24 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  23.03 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  23.24 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  23.24 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  23.24 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  22.58 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  25.42 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  22.42 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  25.66 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  25 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>