28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5511 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  86.1 
 
 		 187 aa  337  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  85.56 
 
 		 187 aa  337  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5946  hypothetical protein  93.67 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4825  hypothetical protein  92.96 
 
 		 79 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0466018 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  31.93 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  24.1 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  24.1 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  29.32 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  24.49 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  29.32 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  25.43 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  25.52 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  30.61 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  24.56 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  23.81 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  31.63 
 
 		 235 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  22.98 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  26.87 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  22.73 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.94 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  24.06 
 
 		 232 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  24.06 
 
 		 232 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  22.62 
 
 		 432 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  30.77 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>