28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3739 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  91.28 
 
 		 195 aa  362  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  97.44 
 
 		 195 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  87.69 
 
 		 195 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  87.69 
 
 		 195 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  86.67 
 
 		 195 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  86.67 
 
 		 195 aa  347  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  314  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  80 
 
 		 195 aa  305  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  79.27 
 
 		 195 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  41.62 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  41.21 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  34.29 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  34.03 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  30 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.27 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  27.88 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  26.4 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  26.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28.05 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  25.41 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  28.57 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  26.26 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  26.26 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.68 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.43 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>