29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0645 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  100 
 
 
146 aa  299  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  37.31 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  32.11 
 
 
236 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  31.25 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  30.89 
 
 
232 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  30.89 
 
 
232 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  28.83 
 
 
195 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  28.83 
 
 
195 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  26.13 
 
 
195 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  26.13 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  25.23 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  26.13 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  25.23 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  27.61 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  30.36 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  29.23 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  29.41 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  32.71 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  24.32 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  26.96 
 
 
259 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.36 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  25.17 
 
 
267 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  25.17 
 
 
237 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  30.19 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  29.23 
 
 
226 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  25.6 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  26.62 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  25.18 
 
 
432 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>