48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1179 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  100 
 
 		 184 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  79.35 
 
 		 183 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  78.45 
 
 		 223 aa  297  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  77.9 
 
 		 183 aa  297  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  40.68 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  39.33 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  40.11 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  38.98 
 
 		 221 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  31.11 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  31.22 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  27.08 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  28.66 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  23.16 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  27.72 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  27.51 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  27.96 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  22.87 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  22.87 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  32.31 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  24.44 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  26.85 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  23.12 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  26.82 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  30.5 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  30.19 
 
 		 432 aa  52  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  30.53 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  30.53 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  21.76 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  22.15 
 
 		 267 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  22.15 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  28.8 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.8 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  26.27 
 
 		 254 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  27.2 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  21.95 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1425  hypothetical protein  29.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>